После исчезновения Лидии из больницы охотники и оборотни вынуждены искать её вместе, хотя доверия между ними почти нет. Скотт пытается сохранить отношения с Эллисон, но её отец запрещает дочери встречаться с ним и всё жёстче готовит её к охоте. Дерек собирает собственную стаю и принимает в неё новых оборотней. Тем временем гибель отца Айзека и появление неизвестного существа связывают школьные тайны с новой опасностью для всего Бикон-Хиллз.

Скотт и Эллисон скрывают отношения от её отца и охотников
Дерек создаёт стаю и принимает в неё Айзека и других оборотней
Джексон пытается понять, что с ним происходит после полнолуния
Скотт, Стайлз и Дерек расследуют нападения загадочной Канимы

Этот сезон заметно мрачнее и тревожнее: романтическая история Скотта и Эллисон всё чаще сталкивается с семейной войной охотников и оборотней. На первый план выходит Канима, чьи нападения превращают привычные школьные места в опасные ловушки. В сюжете больше ночных вылазок, жестоких тренировок и конфликтов внутри новых союзов. Стайлз помогает Скотту разобраться в угрозе, а Дерек действует всё самостоятельнее, из-за чего граница между защитой и опасностью становится особенно зыбкой.